日本注冊公司的年審是在公司設立滿1年，公司運營1年后進行財務申報（決算申報），決算申報結束后（2個月以內），支付法人稅、地方法人稅、法人居民稅、消費稅及地方消費稅。
法人稅
法人稅針對的是公司盈利部分的稅收，類似于其他地區征收的利得稅。
法人收入不超過800萬日元：利益×15.0%
法人收入超過800萬日元：利益×23.4%
法人居民稅
通常依照法人稅的百分比，以及法人規模共同影響計算稅額。
縣民稅：法人稅×1.0%+均等割
市民稅：法人稅×6.0%+均等割
都道府縣民稅和市町村民稅：法人稅的17.3%-20.7%及根據法人規模等計算的一定金額。
法人事業稅
又稱地方法人特別稅。法人事業稅和地方法人特別稅：法人收入的一定比例，各都道府縣的稅率不同，并非一定在該范圍內，注冊資本超過1億日元的法人須另繳納外部標準納稅。
400萬日元以下：利益×5.0%
400萬日元以上：利益×7.3%
800萬日元以上：利益×9.6%
所得稅
這一稅種主要針對的是利息、分紅或其他收入，原則上對在日本國內銀行存款利息代扣代繳國稅 15%，地方稅 5%。
消費稅
通常，消費稅會在日本出售的商品中標明消費稅金額，并且由最終消費者承擔。2019年10月起，將消費稅調高到10%。設立2年內不用交，營業額超過1000萬日元，第四年開始交。
事業所費
這一稅種針對的是東京都特別區、政府指定城市或其他指定城市擁有的營業場所（營業場所達到指定面積以上），并且所屬人員達到指定數量時繳納。
印花稅
對簽訂合同、納稅文件、發票時征收的稅款。
填寫、出具納稅文件及合同、發票時繳納，超過5萬日元的收據需支付印花稅。
