在馬來西亞的各種稅收當中，企業家們最關注的也是企業所得稅和個人所得稅的問題。
1、公司所得稅
馬來西亞公司所得稅和個人所得稅規定均受《1967 年所得稅法》 及其相關修正案約束。公司所得稅的納稅人分為居民納稅人和非居民 納稅人，劃分的標準是公司的實際經營管理機構是否在馬來西亞，若 在馬來西亞就是居民納稅人，履行無限納稅義務，否則就是非居民納 稅人。
2、個人所得稅
馬來西亞公司所得稅和個人所得稅規定均受《1967 年所得稅法》 及其相關修正案約束。馬來西亞個人所得稅是對居住在馬來西亞的自 然人取得的所有收入或非居住在馬來西亞的自然人取得來自馬來西亞的收入按年估值進行征收的稅種。因此，馬來西亞將納稅人分為居民納稅人和非居民納稅人，分別履行無限納稅義務和有限納稅義務。
在馬來西亞注冊公司，投資者最關注的問題還是稅制的問題，馬來西亞的稅制是如何的呢？馬來西亞現行主要稅種有：所得稅、不動產利得稅、 石油所得稅、消費稅等。主要稅收優惠包括：
1、鼓勵國內投資與資 本性投資的措施：
新興企業(包括制造業、農業、飯店、旅游及其他產業）投產5年內，70%的法定所得免納所得稅；對從事資本密集型和高技術投資的企業可以按照逐案審查原則給予全部免稅，免稅期設定在最初5年。
2、投資優惠：
對再投資生產重型機械和普通機械、設備的公司給予再投資優惠。再投資減免額為5年內進行再投資所產生增量收入的70%；對利用椰油生物資源和再投資生產附加值產品的企業，其利潤給予全額免稅優惠，優惠期10年；對從事產業擴張計劃、產業現代化、自動化以及制造工藝多樣化的企業，給予再投資扣除的優惠，再投資扣除額為在15年內發生的用于上述目的的機械設備、廠房的資本性支出的60%。
3、促進出口的優惠措施：
對制造業、農業、飯店、旅游以及服務部門為促進產品出口而產生的費用，采取雙倍扣除等優惠措施。
4、技術與職業培訓的扣除：
對經批準的培訓雇員項目發生的費用允許雙倍扣除；培訓費用雙倍扣除的規定同樣適用于中小型制造業公司。
